Su misión es ejercer la regulación y el control integral sobre los servicios de agua y cloacas en el área de su jurisdicción. Esto incluye el control sobre Aguas Argentinas S.A. y los demás organismos que se prestan bajo la forma de Servicios Desvinculados. Debe controlar:  la calidad de los servicios de agua y cloacas; la aplicación del régimen tarifario y la aprobación de sus modificaciones;  la expansión de los servicios;  los planes de inversión; que los usuarios de los servicios estén atendidos según sus derechos; que se resguarde el patrimonio público cedido en concesión y propiciar toda mejora necesaria a la concesión. Su regulación depende del Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios, la Provincia de Buenos Aires y el Gobierno de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires.