Integra, y depende, de la Procuración General de la Nación como órgano especializado en la investigación de hechos de corrupción y de irregularidades cometidas por agentes de la Administración Nacional. Se trata del personal que integra los organismos centrales, descentralizados o ente en el que el Estado tiene participación. No obstante, la Fiscalía no entiende sobre hechos que tengan lugar en los Poderes Legislativo o Judicial de la Nación, como tampoco en las instancias de Gobierno provinciales o locales.

Para cumplir sus funciones, la FIA realiza investigaciones y actuaciones judiciales en los cuales se investigan irregularidades administrativas y delitos de corrupción supuestamente cometidos por agentes de la Administración Pública Nacional.